Předzpracování snímků Petriho misek

Charakteristika

V balíčku je demo předzpracování snímků Petriho misek s koloniemi kvasinek. Algoritmy, obsažené v demu jsou součástí softwarového nástroje, umožňujícího určit relativní plochu pokrytí misky koloniemi, odhadnout jejich počet a pomocí jednoduchého grafického nástroje tento odhad upřesnit.

Algoritmy, použité v demobalíčku, provedou prahování obrazu, tak, aby bylo odstraněno pozadí snímku, přesnou lokalizaci misky a určí její průměr ve snímku. Použitý způsob zpracování je popsán v přiložené dokumentaci.

Výstupem dema, obsaženého v balíčku, jsou dva snímky: původní snímek s vyznačením středu misky a oblasti zájmu (region-of-interest, ROI) a oprahovaný a oříznutý snímek, obsahující kolonie kvasinek na černém pozadí, s vykreslenou kružnicí oblasti zájmu.

Popis balíku

Název Předzpracování snímků Petriho misek
Jméno souboru dishpreproc.zip
Licence GPL
(See the 'gpl.txt' file in the package.)
Obsah balíku ZIP archiv obsahující demo běžící v prostředí Matlab, ukázkové snímky a dokumentaci.
Velikost 5249048 Bytes
Použité nástroje
& platformy		 Matlab 2008b, Image Processing Toolbox
Poznámky k instalaci
  • Stáhněte balíček
  • Rozzipujte ho
  • Otevřte adresář Demo v prostředí Matlab
  • Demo spusťte voláním funkce demo.m
Viz soubor 'doc/sw_petri_preproc.pdf', obsažený v balíčku.

Kategorie Výsledku

Číslo projektu Sekce kontraktu Rok Kategorie v RIVu Komentář
1M0567 VS1 2009 S Functional sample (demo)

Kontaktní osoba

V případě potřeby kontaktujte odpovědnou osobu, kterou je Zdenek Pohl.